Malý krůček a velký skok

Přátelé, je to malý krůček pro lidstvo, ale velký skok pro klan Šemíků. Bude to delší text, možná ho rozdělím na dvě části. Na začátek krátké shrnutí.

Postupné zpřesňování výsledků Petra

Během ledna došlo k dokončení testu Petra Šemíka a byla vytvořena nová haploskupina R-FT174249. Bez nadsázky můžeme tuto větvičku na Y-DNA stromě udržovaného na stránkách FamilyTreeDNA (ftDNA) nazvat haploskupinou Šemíků.

A nyní si zkusme představit, že neznáme našeho společného předka Adama Šemíka. Odhlédněme, že jsme v posledním desetiletí vypátrali mnohé z historie našeho klanu počínaje polovinou 17. století po současnost. Před půldruhým rokem jsme dosáhli v projektu Genetika a příjmení hrubé ověření, kteří muži s příjmením Šemík mohou či nemohou mít společného předka v řádu několika málo století. Když jsem si v roce 2019 nechal udělat u společnosti Family Tree DNA test, byl jsem v haploskupině R-Y874 jedním z mála Evropanů na západ a severozápad od Černého moře.

11.1.2023 jsem nahrál výsledky na YFull

Až do roku 2021 to takto zůstalo beze změny. Nejbližší společný předek se vyskytoval téměř před 4 tisíci lety kdesi v širším okolí Kaspického moře. Tehdy si na YFull nahrál někdo s vlaječkou Iránu kit YF82979 a tím nás oba posunul ke společnému předkovi zhruba o 1000 let vpřed. Byl jsem s ním na YFull zařazen do podskupiny R-FT172727. Výsledky vzdáleného bratrance na YFull dnes vidět nejsou, protože si zařazení do haplostromu nazaplatil. Na ftDNA není ani tento vzdálený bratranec, ani tato podskupina.

17.1. na YFull vznikla podskupina R-Y184931
(na ftDNA bude pojmenována jako R-FT174249)

Od roku 2021 až do poloviny ledna tohoto roku jsme se dál nepohnuli. A pak došlo ke skoku. Hrubé Petrovy výsledky jsem nahrál na YFull. Mezitím na ftDNA šlo podle prvních výsledků odhadovat dobu života nejbližšího společného předka Romana a Petra. Na základě čtyřech rozdílů na 111 STR markerech vidíme na starším pravděpodobnostním modelu, že předpokládaný odhad 10 generací ke společnému předkovi je bezmála 99%.

Starší model výpočtu TMRCA
(zdroj ftDNA)

V posledních dnech se na ftDNA objevil nový model odhadu. Místo počtu generací zobrazuje interval roků, kdy mohl žít nejbližší společný předek v mužské linii. Na Y-111 markerech máme s Petrem následující rozdíly:

STR            Roman     Petr

DYF395S1 17-17        17     (pozice 40, 41)

DYS556      14             13     (pozice 77)

DYS712      21             23     (pozice 94)

Na Y-67 je jeden rozdíl a na 37, 25 a 12 STR markerech máme úplnou shodu. Jak je vidět z následující tabulky, je odhad optimisticky laděný k mladšímu termínu TMRCA. Ve skutečnosti máme Adama Šemíka genealogickými metodami určeného o desítky let dříve před rokem 1700.

FTDNATiP™ Report

Více se dozvíme v příštím pokračování, které se zaměří na naše terminální SNP R-FT174249 alias R-Y184931.

Na závěr dnešního přemítání jsem zkusil zadat dotaz na fenomén dnešních dnů, tedy model strojového učení za pomoci metod neuronových sítí, zjednodušeně nazýváno umělou inteligencí. Co odpověděl ChatGPT od OpenAI na otázku: jak se zjišťuje TMRCA u Y-DNA?

TMRCA (Time to the Most Recent Common Ancestor) je čas, který uplynul od nejnovějšího společného předka mezi dvěma nebo více jedinci k současnosti. V případě Y-DNA se TMRCA vypočítává pomocí genetického testování Y chromozomu, který se dědí pouze od otce k synovi.

Existuje několik metod, které umožňují vypočítat TMRCA u Y-DNA. Jednou z nejčastěji používaných metod je použití molekulárních hodin, které určují tempo mutací a vývoj chromozomu Y v průběhu času. Pro výpočet TMRCA lze použít různé statistické modely a programy, které zahrnují různé faktory, jako je průměrná míra mutací a délka generace.

Existuje také několik typů markerů, které mohou být testovány při výpočtu TMRCA, jako jsou STR (short tandem repeats) markery a SNP (single nucleotide polymorphism) markery. STR markery se vyznačují vysokou mírou mutací a používají se pro vypočítání relativně nedávných TMRCA (například před několika stovkami let), zatímco SNP markery se vyznačují nižší mírou mutací a používají se pro vypočítání TMRCA vzdálenějších v minulosti (například před tisíci lety).

Je důležité si uvědomit, že výpočet TMRCA není přesný a může být ovlivněn mnoha faktory, jako je počet testovaných markerů, míra mutací, věk mutací a další faktory. Výsledky TMRCA se proto často uvádějí jako intervaly s určitou pravděpodobností namísto konkrétních čísel.